Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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