Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 211.89□□□□□ -0.514e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 DNM1-226ENST00000637317 100 ntTSL 52.81□□□□□ -1.963e-7■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 VDAC3-212ENST00000524291 533 ntTSL 23.61□□□□□ -1.832e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 CCNK-204ENST00000555049 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 CCNK-203ENST00000553865 5627 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.982e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-203ENST00000435082 2023 ntTSL 218.91■□□□□ 0.627e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.317e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-211ENST00000519415 2476 ntTSL 24.41□□□□□ -1.77e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.937e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.037e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.087e-8■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 ASL-210ENST00000496336 996 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.088e-7■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.698e-7■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 AC132008.2-202ENST00000414207 1286 ntTSL 520.94■□□□□ 0.947e-28■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.452e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-206ENST00000484669 744 ntTSL 516.77■□□□□ 0.282e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-208ENST00000487819 840 ntTSL 214.9□□□□□ -0.022e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 THAP3-204ENST00000472925 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.93□□□□□ -0.182e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 ZFAND3-204ENST00000440482 821 ntTSL 312.42□□□□□ -0.422e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.547e-28■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 ZFAND3-202ENST00000373389 531 ntTSL 511.02□□□□□ -0.652e-9■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.973e-11■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12.7
ILF3Q12906 PARP12-205ENST00000473341 2861 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.51e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PARP12-209ENST00000489809 915 ntTSL 313.36□□□□□ -0.271e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PARP12-210ENST00000491598 874 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PARP12-207ENST00000488726 2574 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PARP12-204ENST00000470515 564 ntTSL 37.39□□□□□ -1.231e-9■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 PAWR-203ENST00000547571 732 ntTSL 321.78■■□□□ 1.084e-12■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 LINC00969-207ENST00000429897 2131 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 519.01■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.611e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.371e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-226ENST00000490502 592 ntTSL 313.91□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.831e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.961e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.961e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.961e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.981e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.531e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.991e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.619e-8■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.359e-8■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.289e-8■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.039e-8■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 TAF15-202ENST00000603346 702 ntTSL 26.88□□□□□ -1.319e-8■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.559e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.669e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.789e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 222.24■■□□□ 1.159e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.519e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-203ENST00000570300 565 ntTSL 410.64□□□□□ -0.719e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-216ENST00000574344 573 ntTSL 49.64□□□□□ -0.879e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-204ENST00000570324 414 ntTSL 38.94□□□□□ -0.989e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.269e-7■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 DNA2-202ENST00000399179 3207 ntTSL 26.89□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 12.6
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 124.2 ms