Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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