Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms