Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms