Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4CQ08493 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms