Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms