Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms