Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN11Q06124 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms