Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms