Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms