Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms