Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms