Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EMX1Q04741 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms