Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms