Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms