Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms