Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms