Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL8P80075 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms