Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HBBP68871 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms