Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCS1P62166 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCS1P62166 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCS1P62166 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCS1P62166 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCS1P62166 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms