Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA1P59665 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms