Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA9P57773 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GJA9P57773 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms