Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIPK4P57078 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK4P57078 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms