Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms