Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOSBP53539 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms