Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRE11P49959 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms