Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms