Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPIAP49247 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPIAP49247 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms