Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms