Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms