Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARCN1P48444 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms