Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTRNP46939 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTRNP46939 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTRNP46939 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTRNP46939 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms