Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms