Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms