Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CCP36873 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP1CCP36873 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms