Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNA7P36544 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms