Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms