Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms