Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms