Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER1P34995 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms