Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDAP32320 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDAP32320 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDAP32320 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDAP32320 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDAP32320 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDAP32320 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDAP32320 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms