Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPS1P31327 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms