Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF1P30408 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF1P30408 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms