Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms