Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HRCP23327 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HRCP23327 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HRCP23327 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HRCP23327 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HRCP23327 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HRCP23327 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms