Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD247P20963 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD247P20963 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD247P20963 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms