Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGCP20142 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGCP20142 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGCP20142 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGCP20142 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms