Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT4P19013 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT4P19013 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT4P19013 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms