Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPD1P17405 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms